Report in report.pdf
.
├── README.md
├── constant
│ └── constant.R
├── data
│ ├── processed
│ │ ├── a.csv
│ │ ├── b.csv
│ │ ├── c.csv
│ │ ├── d.csv
│ │ ├── e.csv
│ │ └── rdate.csv
│ └── raw
│ └── owid_Sep5.csv
├── function
│ ├── add_cyclic.R
│ ├── disc_gamma.R
│ ├── gen_data.R
│ ├── get_iwt.R
│ ├── make_plot.R
│ ├── process_data.R
│ ├── run_trend_filter.R
│ └── util.R
├── model
│ ├── pls
│ │ ├── penalties_nonsmooth.R
│ │ └── penalties_smooth.R
│ └── vae
├── plot
│ ├── epiestim
│ │ ├── a.png
│ │ └── b.png
│ ├── epiinvert
│ ├── epinow
│ │ ├── a.png
│ │ └── b.png
│ └── pls
│ ├── a.png
│ ├── a_1day_pois.png
│ ├── a_pois.png
│ ├── b.png
│ ├── b_1day_pois.png
│ └── b_pois.png
├── report.Rmd
├── report.pdf
└── run
├── run_EpiEstim.R
├── run_EpiInvert.R
├── run_EpiNow.R
└── run_Pl_simple.R
14 directories, 35 files