Pinned Repositories
2018-cicese-metatranscriptomics
repo for cicese metatranscriptomics workshop, nov 2018
2020-NGSInfectedBodyFluids
scripts and data for Gu et al Nature Medicine 2020 manuscript
AgingMicrobiome
Aging Microbiome paper Wilmanski et. al.
analytics_vidhya
Codes related to activities on AV including articles, hackathons and discussions.
ariba
Antimicrobial Resistance Identification By Assembly
automation-report
Automation report是一款可以解决很多行业领域中设涉及到报告生成的需求，本项目最开始的初衷是为公司内部简化人工流程的一个环节，主要实现目的是将实验室检测得出的下机数据结果与对应的报告模版批量结合生成报告(.pdf)。
Beautiful-Visualization-with-R
《R语言数据可视化之美》配套代码
c_AMPs-prediction
CaDRReS
Cancer Drug Response prediction using a Recommender System
chinese_nlp
中文自然语言处理入门实战课程语料
zhenghaihui315's Repositories
zhenghaihui315/2018-cicese-metatranscriptomics
repo for cicese metatranscriptomics workshop, nov 2018
zhenghaihui315/2020-NGSInfectedBodyFluids
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Aging Microbiome paper Wilmanski et. al.
zhenghaihui315/analytics_vidhya
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Antimicrobial Resistance Identification By Assembly
zhenghaihui315/Beautiful-Visualization-with-R
《R语言数据可视化之美》配套代码
zhenghaihui315/c_AMPs-prediction
zhenghaihui315/CaDRReS
Cancer Drug Response prediction using a Recommender System
zhenghaihui315/covid_balf
R script for the covid balf data analysis
zhenghaihui315/FeatureSelectionsAndExtractions
feature selections and extractions
zhenghaihui315/funNLP
中英文敏感词、语言检测、中外手机/电话归属地/运营商查询、名字推断性别、手机号抽取、身份证抽取、邮箱抽取、中日文人名库、中文缩写库、拆字词典、词汇情感值、停用词、反动词表、暴恐词表、繁简体转换、英文模拟中文发音、汪峰歌词生成器、职业名称词库、同义词库、反义词库、否定词库、汽车品牌词库、汽车零件词库、连续英文切割、各种中文词向量、公司名字大全、古诗词库、IT词库、财经词库、成语词库、地名词库、历史名人词库、诗词词库、医学词库、饮食词库、法律词库、汽车词库、动物词库、中文聊天语料、中文谣言数据、百度中文问答数据集、句子相似度匹配算法集合、bert资源、文本生成&摘要相关工具、cocoNLP信息抽取工具、国内电话号码正则匹配、清华大学XLORE:中英文跨语言百科知识图谱、清华大学人工智能技术系列报告、自然语言生成、NLU太难了系列、自动对联数据及机器人、用户名黑名单列表、罪名法务名词及分类模型、微信公众号语料、cs224n深度学习自然语言处理课程、中文手写汉字识别、中文自然语言处理 语料/数据集、变量命名神器、分词语料库+代码、任务型对话英文数据集、ASR 语音数据集 + 基于深度学习的中文语音识别系统、笑声检测器、Microsoft多语言数字/单位/如日期时间识别包、中华新华字典数据库及api(包括常用歇后语、成语、词语和汉字)、文档图谱自动生成、SpaCy 中文模型、Common Voice语音识别数据集新版、神经网络关系抽取、基于bert的命名实体识别、关键词(Keyphrase)抽取包pke、基于医疗领域知识图谱的问答系统、基于依存句法与语义角色标注的事件三元组抽取、依存句法分析4万句高质量标注数据、cnocr：用来做中文OCR的Python3包、中文人物关系知识图谱项目、中文nlp竞赛项目及代码汇总、中文字符数据、speech-aligner: 从“人声语音”及其“语言文本”产生音素级别时间对齐标注的工具、AmpliGraph: 知识图谱表示学习(Python)库：知识图谱概念链接预测、Scattertext 文本可视化(python)、语言/知识表示工具：BERT & ERNIE、中文对比英文自然语言处理NLP的区别综述、Synonyms中文近义词工具包、HarvestText领域自适应文本挖掘工具（新词发现-情感分析-实体链接等）、word2word：(Python)方便易用的多语言词-词对集：62种语言/3,564个多语言对、语音识别语料生成工具：从具有音频/字幕的在线视频创建自动语音识别(ASR)语料库、构建医疗实体识别的模型（包含词典和语料标注）、单文档非监督的关键词抽取、Kashgari中使用gpt-2语言模型、开源的金融投资数据提取工具、文本自动摘要库TextTeaser: 仅支持英文、人民日报语料处理工具集、一些关于自然语言的基本模型、基于14W歌曲知识库的问答尝试--功能包括歌词接龙and已知歌词找歌曲以及歌曲歌手歌词三角关系的问答、基于Siamese bilstm模型的相似句子判定模型并提供训练数据集和测试数据集、用Transformer编解码模型实现的根据Hacker News文章标题自动生成评论、用BERT进行序列标记和文本分类的模板代码、LitBank：NLP数据集——支持自然语言处理和计算人文学科任务的100部带标记英文小说语料、百度开源的基准信息抽取系统、虚假新闻数据集、Facebook: LAMA语言模型分析，提供Transformer-XL/BERT/ELMo/GPT预训练语言模型的统一访问接口、CommonsenseQA：面向常识的英文QA挑战、中文知识图谱资料、数据及工具、各大公司内部里大牛分享的技术文档 PDF 或者 PPT、自然语言生成SQL语句（英文）、中文NLP数据增强（EDA）工具、英文NLP数据增强工具 、基于医药知识图谱的智能问答系统、京东商品知识图谱、基于mongodb存储的军事领域知识图谱问答项目、基于远监督的中文关系抽取、语音情感分析、中文ULMFiT-情感分析-文本分类-语料及模型、一个拍照做题程序、世界各国大规模人名库、一个利用有趣中文语料库 qingyun 训练出来的中文聊天机器人、中文聊天机器人seqGAN、省市区镇行政区划数据带拼音标注、教育行业新闻语料库包含自动文摘功能、开放了对话机器人-知识图谱-语义理解-自然语言处理工具及数据、中文知识图谱：基于百度百科中文页面-抽取三元组信息-构建中文知识图谱、masr: 中文语音识别-提供预训练模型-高识别率、Python音频数据增广库、中文全词覆盖BERT及两份阅读理解数据、ConvLab：开源多域端到端对话系统平台、中文自然语言处理数据集、基于最新版本rasa搭建的对话系统、基于TensorFlow和BERT的管道式实体及关系抽取、一个小型的证券知识图谱/知识库、复盘所有NLP比赛的TOP方案、OpenCLaP：多领域开源中文预训练语言模型仓库、中文自然语言处理向量合集、基于金融-司法领域(兼有闲聊性质)的聊天机器人、g2pC：基于上下文的汉语读音自动标记模块、Zincbase 知识图谱构建工具包、诗歌质量评价/细粒度情感诗歌语料库。
zhenghaihui315/GEO
zhenghaihui315/german_mgwas_code
zhenghaihui315/GWA_tutorial
A comprehensive tutorial about GWAS and PRS
zhenghaihui315/Liu2020ProteinCell
Pipeline & Reproducible analysis examples for amplicon and metagenome in microbiome
zhenghaihui315/mbtools
R package for microbiome analysis. Provides helper functions for common workflows ranging from preprocessing to visualization.
zhenghaihui315/meddiet2020
zhenghaihui315/MicrobiomeProtocol
Microbiome Protocol eBook related documents and scripts.
zhenghaihui315/MOLI
MOLI: Multi-Omics Late Integration with deep neural networks for drug response prediction
zhenghaihui315/ncomms-20-10056-t
zhenghaihui315/neural_collaborative_filtering
Neural Collaborative Filtering
zhenghaihui315/oralAtlas
Code used in oral atlas manuscript
zhenghaihui315/python_zeroing-
Spider of ENZHA
zhenghaihui315/QIIME2ChineseManual
QIIME 2中文文档(QIIME 2 Chinese Manual)
zhenghaihui315/single-cell-tutorial
Single cell current best practices tutorial case study for the paper:Luecken and Theis, "Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutorial"
zhenghaihui315/SURPI-plus-dist
zhenghaihui315/tensorflow2_tutorials_chinese
tensorflow2中文教程，持续更新(当前版本:tensorflow2.0)，tag: tensorflow 2.0 tutorials
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C++ library and cmdline tools for parsing and manipulating VCF files
zhenghaihui315/Wrapper-Feature-Selection-Toolbox-Python
This toolbox offers 13 wrapper feature selection methods (PSO, GA, GWO, HHO, BA, WOA, and etc.) with examples. It is simple and easy to implement.
zhenghaihui315/zhihu
This repo contains the source code in my personal column (https://zhuanlan.zhihu.com/zhaoyeyu), implemented using Python 3.6. Including Natural Language Processing and Computer Vision projects, such as text generation, machine translation, deep convolution GAN and other actual combat code.