由组学大讲堂提供的,为生物数据分析提供各种生物信息分析软件的docker 镜像. 解决安装Linux生物分析软件系统环境兼容问题,让生物学家把更多的时间投入到自己的数据分析中,而不是把时间浪费在软件的安装与调试上。
docker使用学习笔记:https://www.omicsclass.com/article/1181
docker基础与使用视频课程:实验室linux生信分析平台搭建
$ docker search omicsclass #搜索镜像
INDEX NAME DESCRIPTION STARS OFFICIAL AUTOMATED
docker.io docker.io/omicsclass/biocontainer-base Biocontainers base Image 0
docker.io docker.io/omicsclass/bwa BWA v0.7.17 build by omicsclass 0
docker.io docker.io/omicsclass/isoseq3 isoseq3 v3.3.0 build by omicsclass 0
docker.io docker.io/omicsclass/samtools samtools v1.10 build by omicsclass 0
$ docker pull docker.io/omicsclass/samtools:latest #下载镜像
$ docker images #查看镜像
REPOSITORY TAG IMAGE ID CREATED SIZE
omicsclass/isoseq3 latest cebd646cb441 19 hours ago 2.27 GB
omicsclass/bwa latest 21d75ee161fa 41 hours ago 1.06 GB
omicsclass/samtools latest d505ac3f6c30 42 hours ago 988 MB
omicsclass/biocontainer-base latest 3501aa40f5a7 2 days ago 669 MB
docker.io/centos centos7 5e35e350aded 4 months ago 203 MB