new problem in the GGMsa

[fishboyID]

new problem in the GGMsa

[fishboyID]

我在用ggmsa进行两两序列的差异比较可视化时，在运行“x=seqdiff(fas[1])”老是显示错误“'filepath' must be a character vector with no NAs”，可是我的文件路径已经很简化，问题依然有，请帮忙给看看问题出在哪儿?
112.txt

[nyzhoulang]

你好， @fishboyID

我使用了你提供的示例文件112.txt，它在seqdiff函数中是可以正常使用的，请看下面代码：

## Use the .fas suffix instead of .txt

library(ggmsa)
x <- seqdiff(fasta = "112.fas")
plot(x)

需要注意的是：seqdiff 函数的第一个参数fasta需要输入fasta文件路径。

我看到你已经设置了工作路径为: E\seq，并且工作目录包含对应双序列比对文件，
所以可以直接在seqdiff中输入对应文件，如：seqdiff("11.fasta")

YuLab,
Zhou Lang

[fishboyID]

周老师，太感谢您了，我按照您的指导重现了您操作的结果，万分感谢。