/CaSCaDe

Code for CaSCaDe

Primary LanguageMATLAB

CaSCaDe

使い方

Main_Code.mを開いて実行する。

GUIが起動するため、解析したい画像tifファイルを開く。

改変場所

Cal_anl_main2sa_forreview_x.mにおいて、res.testdata = prepSVMData(pkf);をコメントアウト

get_peak_feature.mにおいて、autocorrをxcorrに変更

The code is organized and modified from the supplement of paper:

Agarwal, Amit, et al. "Transient opening of the mitochondrial permeability transition pore induces microdomain calcium transients in astrocyte processes." Neuron 93.3 (2017): 587-605.

The main file is Cal_anl_main2sa_forreview_x.m.

Some extra parameters are exposed to users.