the GUI tool for taking a region of interest (ROI) from a fluorescence image
MATLAB
Open "Get_ROI.m" and run the code (F5 or RUN). Select the image (tif file). Image must be the 8 or 16 bit grascale tif image.
"Get_ROI.m"を開いて、F5または実行ボタンで実行すると、画像選択画面が現れる。ROI取りをしたい画像を選択する。 画像は8または16bitのグレースケールのtif画像である必要がある。
平均化フィルタと二値化を組み合わせて細胞領域を取り出す。
Get area→クリックしたところをつながった部分をとる
Get line→クリックした2点の間の軸索探索
パラメータを確認しながら、ROI取りできる。
赤：元画像 緑：ワークスペース 青：取得したROI をそれぞれ表している。
You can use the "demo_image_8bit.tif" or "demo_image_16bit.tif" for demos.
"demo_image_8bit.tif" または "demo_image_16bit.tif"をデモとして使用できる。
Takehiro Ajioka
E-mail:1790651m@stu.kobe-u.ac.jp
Division of System Neuroscience, Kobe University of Graduate School of Medicine
神戸大学医学研究科システム生理学分野