jolo

Jupyter / voilà interface to OLOGRAM

Try with mybinder

sudo apt-get install bedtools

Interface web
- Trois onglets:
  - OLOGRAM
  - OLOGRAM-MODL
  - MERGE_STATS
    - Input (+)
    - Ajouterai un nom et un tsv
Proposer des jeux exemple.
- Jeux artificiel
- Données réels
Aide contextuelle sur chaque argument (cf CLI)
- Zone chargement de fichiers
- Upload de plusieurs fichiers
- paramètres
Comment fait on avec les GTF de référence
Output
- Un fichier pdf + un tsv
On devrait pouvoir construire un format html en sortie
- Graph interactif
  - bqplot
  - altair
On voit la commande envoyée par l’utilisateur
Serveur avec un scheduler (load balancing ?):
Slurm
- Définir la mémoire
Qsub
Comment l’utilisateur suit son travail
- s’identifier / on simplement donner son adresse.
Une URL qu’il pourra consulter avec son résultat.
Les résultats ont une certaine pérennité
Migrable facilement