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Club de Programmation de l'IBIS

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Note

Cette page est une archive des activités entre 2014 et 2016 du Club Bioinfo IBIS qui a été dissolu en 2019.

Objectifs

Le Club Bioinfo IBIS a pour mission de promouvoir le partage de connaissances bioinformatique entre les équipes de recherche de l'Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS, Université Laval). Le club tient régulièrement des présentations publiques, des ateliers de formation et des discussions en groupe organisés par et pour les membres de l'IBIS (étudiants, stagiaires postdoctoraux, professeurs, personnel technique). Les sujets abordés sont laissés à la discrétion des présentateurs et touchent tant la bioinformatique fondamentale (e.g. programmation, algorithmique) qu'appliquée (e.g. génomique, protéomique, biostatistique).

  • Partager aptitudes d'analyse au sein de l'IBIS
  • Familiariser avec outils bioinfo et Linux/UNIX
  • Présenter des sujets de bioinfo utiles
  • Transfer de connaissances

Formule

Présentations, ateliers et discussions

2016

  • 4 octobre - Eric Normandeau (Équipe de Louis Bernatchez) : Gestion de libraries Python avec Conda Présentation

  • 24 mai - Stéphane Larose (Support bioinformatique de l'IBIS) : Système de soumission de tâches - De SGE vers SLURM Présentation

  • 26 avril - Luca Freschi (Équipe de Roger Lévesque) : L'art de rechercher et de comparer des séquences biologiques Présentation

  • 29 mars - Julie Jeukens (Équipe de Roger Lévesque) : La genèse d’un pipeline d’assemblage de génomes bactériens Présentation

  • 1er mars - Eric Normandeau (Équipe de Louis Bernatchez) : Comparer facilement des cartes génétiques avec MapComp Présentation Logiciel

  • 16 février - Jérôme Laroche (Plate-Forme de bioinformatique) : Les services de la plate forme de bioionformatique de l'IBIS Présentation

  • 2 février - Jeff Gauthier (Équipe de Nicolas Derome) : Une brève histoire de la bioinformatique Présentation

2015

  • 1er décembre - Jeff Gauthier (Équipe de Nicolas Derome) : Une brève histoire de la bioinformatique Présentation

  • 20 octobre - Maxime Boissonneault (Calcul Québec) : Le calcul informatique de pointe au service de la bioinformatique Présentation

  • 6 octobre - Katherine Tanaka (Équipe de Steve Charette) : abISsal - Développement d'un outil pour détecter les évènements de translocalisation d'éléments IS chez Aeromonas salmonicida ssp. salmonicida (13h15, salle Hydro-Québec) Présentation

  • 21 juillet - Marie Filteau (Équipe de Christian Landry) : JMP12 : l'art de l'analyse de données (13h, salle Hydro-Québec) Présentation, Fichiers et document aide-mémoire

  • 27 janvier - Eric Normandeau (Équipe de Louis Bernatchez) : Présentation et Scripts

  • 10 février - François-Oliver Gagnon-Hébert (Équipe de Nadia Aubin-Horth) : Optimisation d'assemblage de novo Présentation

  • 10 mars - Jean-Guillaume Emond-Rheault (Équipe de Steve Charette) : Analyses génomique Présentation

  • 24 mars - Xavier Barbeau (Équipe de Patrick Lagüe) : Modélisation de protéines

  • 7 avril - Bachar Cheaib (Équipe de Nicolas Derome) : Analyse de métagénomes Présentation

  • 21 avril - Laura Benestan (Équipe de Louis Bernatchez) : Séquençage RAD/GBS Présentation

2014

Licence

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