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宏基因数据统计可视化自动分析流程(Metagenomics Stat and Visual)

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宏基因数据统计可视化自动分析流程(Metagenomics Stat and Visual)

##本分析流程(无其他软件的调用)主要用于基于宏基因丰度数据的相关分析,可应用于如下场景:

###背景###:
----1.当前有n样本,比对IGC后生成这n个样本的丰度矩阵
----2.有k个课题基因(如肠道微生物药物代谢酶基因,抗生素基因等)

###目的###:
----1.从样本丰度矩阵中提取出这些基因,用于后续分析(降维,相当于特征提取)
----2.想要研究清楚这些基因在这些样本(不同表型)中的分布情况,比如在不同地区这些基因的分布情况,不同疾病里这些基因的分布情况

###结果###:
----1.降维后的丰度矩阵

----2.不同表型(疾病or地区等)分布的人群中,k个课题基因分布箱线图

----图表展示1:不同地区某微生物药物代谢基因分布

Gene example


----图表展示2:不同地区某微生物药物代谢物种分布

Species example