/pro-oc-mutation-finder-vfn-reports

Datové sady mutací viru Sars-Cov-2 zjištěných Diskriminačními RT-PCR testy v ČR a to převážně z laboratoří ve VFN.

Primary LanguageShell

PRO OC Mutation finder VFN reports

Jedná se o subsety dat z ISIN zasílané k vyhodnocení národní referenční laboratoři v ČR - NRL pro chřipku. Zprávy k výsledkům NRF pravidelně přidává na této stránce. Tato data obsahují kromě věku (data narození), který NRF ve zprávě k výsledku pravidelně zveřejňuje na slajdu Věková struktura sekvenovaných v kontextu převažujících variant také pohlaví.

Aktuality

02.03.2022 - Report obsahuje všechny zjištěné mutace diskriminačními RT-PCR testy v ČR u pacientů, kterým byla vystavená žádanka na test v OC VFN v období mezi 1.1.2021 a 02.03.2022 (pro rok 2020 nejsou data) v následujícím formátu:

[dd.] [mm.] [yyyy] [číslo žádanky] [datum narození] [pohlaví = žena/muž] [název mutace] [výsledek = pozitivní/negativní] [název všech laboratoří, které vzorek zpracovávaly s odstraněnými duplikátními záznamy, oddělovač je použit čárka = lab1.KodMista&lab1.NazevMista&lab1.ICO,lab2.KodMista.. = PHA-325&Všeobecná fakultní nemocnice v Praze&64165]
  • [ a ] značí sloupce, které jsou oddělené mezerou

Odkazy k získání a vyhodnocení reportu

PRO OC Mutation Finder
Přehledy zpracované Národní referenční laboratoří pro SARS-CoV-2 - NRL pro chřipku
Outbreak.info
virus.img.cas.cz
Obdobný report z FNB - Fakultní nemocnice Bulovka