/sars-cov-2-mutation-reports

Datové sady mutací viru Sars-Cov-2 zjištěných Diskriminačními RT-PCR testy v ČR a to převážně z laboratoří ve FNB.

SARS‑CoV‑2 Mutation Reports

Jedná se o subsety dat z ISIN zasílané k vyhodnocení národní referenční laboratoři v ČR - NRL pro chřipku. Zprávy k výsledkům NRF pravidelně přidává na této stránce. Tato data obsahují kromě věku (data narození), který NRF ve zprávě k výsledku pravidelně zveřejňuje na slajdu Věková struktura sekvenovaných v kontextu převažujících variant také pohlaví.

Aktuality

16.04.2023 - Report obsahuje všechny zjištěné mutace diskriminačními RT-PCR testy v ČR u pacientů, kterým byla vystavená žádanka na test ve FNB (fakultní nemocnice Bulovka) a v období mezi 27.5.2021 a 08.12.2022 v následujícím formátu:

[dd.] [mm.] [yyyy] [číslo žádanky] [datum narození] [pohlaví = žena/muž] [název mutace] [výsledek = pozitivní/negativní] [název všech laboratoří, které vzorek zpracovávaly s odstraněnými duplikovanými záznamy, oddělovač je použit čárka = lab1.KodMista&lab1.NazevMista&lab1.ICO,lab2.KodMista.. = PHA-45&Nemocnice na Bulovce&64211]
  • [ a ] značí sloupce, které jsou oddělené mezerou

Odkazy k získání a vyhodnocení reportu

PRO OC Mutation Finder
Přehledy zpracované Národní referenční laboratoří pro SARS-CoV-2 - NRL pro chřipku
Outbreak.info
virus.img.cas.cz
Obdobný report z VFN - Všeobecné fakultní nemocnice v Praze
Vyhodnocení reportu v návaznosti na report z VFN a projekt celogenomového sekvenování virus.img.cas.cz